Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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