Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
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