Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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