Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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