Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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