Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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