Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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