Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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