Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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PTP4A2Q12974 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTP4A2Q12974 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTP4A2Q12974 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTP4A2Q12974 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTP4A2Q12974 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTP4A2Q12974 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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PTP4A2Q12974 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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