Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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