Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPRJQ12913 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPRJQ12913 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPRJQ12913 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPRJQ12913 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPRJQ12913 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPRJQ12913 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PTPRJQ12913 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PTPRJQ12913 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PTPRJQ12913 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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