Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN2AQ12879 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
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