Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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