Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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KCNMA1Q12791 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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