Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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GTF3C1Q12789 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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GTF3C1Q12789 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GTF3C1Q12789 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GTF3C1Q12789 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GTF3C1Q12789 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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