Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms