Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms