Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms