Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms