Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms