Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms