Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms