Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EMX2Q04743 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms