Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms