Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms