Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms