Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms