Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms