Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms