Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms