Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB1P82279 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB1P82279 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB1P82279 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRB1P82279 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms