Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2NP61088 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms