Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms