Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms