Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms