Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP7P55210 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP7P55210 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP7P55210 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP7P55210 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms