Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFDNP55196 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AFDNP55196 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFDNP55196 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFDNP55196 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFDNP55196 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AFDNP55196 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFDNP55196 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFDNP55196 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFDNP55196 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFDNP55196 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFDNP55196 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFDNP55196 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFDNP55196 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms