Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAPAP54920 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms