Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms