Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARSP54136 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARSP54136 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARSP54136 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARSP54136 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARSP54136 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARSP54136 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms