Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms