Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC3P51654 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC3P51654 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms