Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms