Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNA2P51530 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNA2P51530 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNA2P51530 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNA2P51530 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNA2P51530 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNA2P51530 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNA2P51530 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNA2P51530 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNA2P51530 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNA2P51530 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNA2P51530 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNA2P51530 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DNA2P51530 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNA2P51530 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms