Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP4P49662 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP4P49662 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP4P49662 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms