Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NESP48681 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NESP48681 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NESP48681 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NESP48681 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NESP48681 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NESP48681 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NESP48681 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NESP48681 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NESP48681 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NESP48681 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NESP48681 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NESP48681 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NESP48681 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NESP48681 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NESP48681 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NESP48681 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NESP48681 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NESP48681 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NESP48681 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NESP48681 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NESP48681 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NESP48681 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NESP48681 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NESP48681 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NESP48681 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NESP48681 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms