Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms