Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNT2P45379 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms