Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBRP36941 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBRP36941 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBRP36941 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBRP36941 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms