Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms